Microscopia

A Unidade de Microscopia possui o know-how científico e conhecimento técnico em microscopia avançada e em processamento de imagem para providenciar suporte e potenciar a investigação científica. Estão disponíveis para toda a comunidade científica (NOVA Medical School e utilizadores externos) uma variada gama de instrumentos de microscopia desde aplicações simples a aplicações avançadas.

Os funcionários da unidade providenciam: ajuda aos investigadores no planeamento experimental de experiências de microscopia; formação na utilização dos instrumentos assim como troubleshooting durante o manuseamento dos mesmos; serviços de processamento de imagem, renderização e análise dos dados adquiridos. Se necessário, poderão ser elaboradas a pedido rotinas customizadas de análise de imagem.

De modo a manter os padrões elevados do serviço, é a nossa missão manter os instrumentos atualizados e o staff a par dos últimos desenvolvimentos e técnicas disponíveis no campo da microscopia.

Equipamentos e Serviços

EQUIPAMENTO

Confocal Zeiss LSM 980 com Airyscan 2
Confocal Zeiss LSM 710
Confocal Andor Spinning disk
Widefield Observer Z1 for HCS
Widefield Axioimager Z2
Lupa Lumar V12 com fluorescência
Lupa Leica MZ16A com fluorescência
Lupa Stereo V8 com fluorescência
Múltiplas Lupas mais pequenas com/sem fluorescência
Workstation 1 with Imaris 10.2, Huygens 24.10, ZEN 3.1 Workstation
Confocal Zeiss cell observer spinning disk

SERVIÇOS

Formação em todos os microscópios, para utilização independente
Consultoria e planeamento de projetos/experiencias
Consultoria em preparação de amostras
Formação em processamento de imagem (Fiji, IMARIS, Icy,..)
Serviços de processamento e analise de imagem: Automação (macros, scripts);
Consultoria e desenvolvimento de etapas de processamento de imagem; Desenvolvimento de aplicações customizadas de processamento de imagem

Outros serviços:

Captura e análise de imagens de alta resolução para validação de biomarcadores morfológicos e de expressão
Disponibilizamos imagens de alta qualidade de amostras biológicas — incluindo células cultivadas, organoides, tecidos de modelos animais e amostras humanas — utilizando várias técnicas de microscopia (campo claro, fluorescência, confocal, etc.). O foco principal é a análise quantitativa de imagens para validação de biomarcadores. Isso inclui a deteção e quantificação de alterações morfológicas (por exemplo, morfologia celular, estrutura de tecidos, alterações em organelos), a localização e quantificação de biomarcadores de expressão proteica ou genética (através de imunofluorescência ou hibridização in situ) e a análise da distribuição espacial de elementos celulares ou moleculares.
O aspeto inovador deste serviço reside na utilização de algoritmos automatizados de análise de imagens e técnicas de aprendizagem automática para extrair biomarcadores quantificáveis a partir de imagens complexas. Por exemplo, a experiência e a capacidade de analisar com precisão imagens OCT humanas podem ser aplicadas a modelos pré-clínicos ou alargadas à avaliação de outras estruturas. Este serviço transforma dados visuais em biomarcadores quantitativos e estatisticamente robustos, permitindo a deteção de efeitos subtis causados por fatores ambientais ou respostas imunitárias.
Validação visual e funcional de biomarcadores em modelos 3D (organóides e tumoroides)
Com a crescente relevância dos modelos 3D desenvolvidos pela Unidade de Cultura Celular, a Unidade de Microscopia oferece serviços de aquisição de imagens (incluindo imagens de células vivas, quando aplicável) e análise quantitativa dessas estruturas complexas. Isso permite a monitorização do desenvolvimento, organização e diferenciação de modelos 3D, bem como a validação da expressão de biomarcadores e sua localização relacionados a doenças ou exposição, fornecendo uma representação visual clara do efeito de fatores ambientais ou intervenções terapêuticas.
A microscopia de alta resolução é essencial para explorar a complexidade estrutural e funcional dos modelos 3D. Este serviço permite a validação de biomarcadores funcionais e morfológicos identificados nestes sistemas, correlacionando a expressão de proteínas ou a atividade de vias com a morfologia 3D. Tal capacidade é crucial para traduzir descobertas in vitro para contextos in vivo e para validar biomarcadores relevantes para tecidos e órgãos.
Apoio e consultoria em desenho experimental e análise de imagens para estudos de biomarcadores
Além da aquisição e análise de imagens, a Unidade de Microscopia oferece consultoria especializada em desenho experimental para estudos de biomarcadores baseados em imagens. Isso inclui a otimização de protocolos de coloração (imunofluorescência, fluorocromos), a seleção das técnicas de microscopia mais adequadas e o apoio na interpretação e apresentação de dados de imagens quantificados.
O valor acrescentado reside na experiência que vai além da execução técnica. Ao oferecer apoio tanto na conceção como na interpretação de dados, a unidade de microscopia não só fornece dados de alta qualidade, como também ajuda a maximizar o potencial das suas amostras para a descoberta e validação de biomarcadores. Isto garante que a informação visual é utilizada de forma eficaz para abordar questões científicas. Esta consultoria é especialmente valiosa para consórcios com uma formação predominantemente clínica, colmatando as lacunas entre o conhecimentos clínico e o fluxo de trabalho de imagem experimental.

Galeria de fotos

Como Usar o Serviço

A utilização da Unidade de Microscopia está disponível para toda a comunidade. Novos utilizadores necessitam de se registar na plataforma de calendário (Agendo) - https://fcm.agendoscience.com - e requisitar permissão para os equipamentos pretendidos.

Utilizadores externos poderão contactar a unidade via email. Formação especializada em todos os equipamentos é obrigatória antes de utilizar os recursos da unidade.